Data genomik adalah informasi yang sangat detail tentang DNA atau RNA suatu organisme. Misalnya, untuk menganalisis genom manusia, kita perlu memproses miliran potongan data. Tanpa sistem komputasi yang kuat, proses ini bisa memakan waktu berhari-hari atau bahkan berminggu-minggu. High Performance Computing (HPC) adalah teknologi komputasi yang menggabungkan ribuan prosesor dalam sebuah sistem terintegrasi untuk melakukan pemrosesan data skala besar dengan kecepatan luar biasa.
HPC memungkinkan analisis kompleks seperti simulasi iklim, pemodelan molekul, atau DNA sequencing, yang sebelumnya memakan waktu berhari-hari, dapat diselesaikan dalam hitungan menit atau jam . Dengan HPC, tugas-tugas ini dapat dibagi menjadi bagian-bagian kecil dan dikerjakan secara bersamaan oleh ratusan atau ribuan prosesor. Ini seperti memiliki tim besar yang bekerja sama untuk menyelesaikan pekerjaan dengan cepat.
Bagaimana HPC Membantu EPI2ME?
Platform EPI2ME dari Oxford Nanopore Technologies telah menjadi pionir analisis data sekuensing long-read, menawarkan lebih dari 15 workflow siap pakai untuk aplikasi seperti deteksi varian genetik, analisis transkriptom, dan klasifikasi metagenomik. Workflow EPI2ME mengandalkan kerangka kerja Nextflow yang memungkinkan integrasi dengan container dan skalabilitas ke level cloud atau cluster . Di sinilah HPC berperan krusial dalam mengoptimalkan kinerja workflow Epi2me, mempercepat waktu analisis, dan memungkinkan penemuan ilmiah yang lebih mendalam.
Fleksibilitas dengan Cloud dan Perangkat Nanopore
Epi2ME tidak hanya bisa dijalankan di komputer lokal, tetapi juga di cloud dan perangkat sekuensing portable seperti GridION atau PromethION. Ini memberikan fleksibilitas besar bagi peneliti :
- Analisis Langsung di Lapangan: Misalnya, saat meneliti wabah di daerah terpencil, data bisa dianalisis langsung di perangkat portabel sambul sekuensing berlangsung.
- Penyimpanan Aman di Cloud: Hasil analisis bisa disimpan di cloud, sehingga bisa diakses dari mana saja dan kapan saja.
Tingkatkan Kapasitas Analisis Genomik Anda dengan Solusi HPC Kami!
Kombinasi HPC dan Epi2ME membuka peluang untuk inovasi lebih lanjut, seperti penggunaan kecerdasan buatan (AI) untuk memprediksi hasil analisis secara lebih cerdas. Misalnya, AI bisa membantu mengidentifikasi pola dalam data genomik yang mungkin terlewat oleh manusia. Dengan dukungan HPC, Epi2ME tidak hanya menjadi alat untuk peneliti, tetapi juga solusi praktis untuk berbagai bidang, seperti kesehatan, pertanian, dan lingkungan. Teknologi ini memungkinkan kita memahami kehidupan di tingkat molekuler dengan lebih baik, membuka jalan bagi penemuan-penemuan baru yang bisa mengubah dunia.
ADVISAINS menyediakan solusi HPC terintegrasi yang dirancang khusus untuk mendukung workflow bioinformatika seperti Epi2ME.
👉 Hubungi tim ahli kami hari ini di [email/telepon] atau kunjungi [tautan website] untuk konsultasi gratis dan demo solusi HPC yang disesuaikan dengan kebutuhan proyek Epi2ME Anda.